伴随着粤港澳三地协同创新发展趋势日益显著，粤港澳大湾区建设的理念和方案被正式提上日程，为国家培养新时期符合粤港澳三地社会发展需求的创新型复合型人才及输出引领技术革命的科技创新成果成为了三地高校重要的历史使命和具有普遍共识的战略愿景。2015年，中山大学率先倡议并与香港中文大学和澳门大学共同着手组建粤港澳高校联盟（以下简称“联盟”），以期汇聚三地精英高校优质教研资源，深化三地高校教育交流合作，共同打造“粤港澳一小时学术圈”，助力粤港澳大湾区与国家“一带一路”的建设。

2015年6月23日，教育部港澳台事务办公室正式批准组建联盟；2016年11月15日，在国家和三地相关政府部门的支持和指导下，联盟于中山大学正式成立。联盟是粤港澳地区高校自愿组成的非营利性的大学合作组织，到目前为止粤港澳三地共有37所精英高校入盟（广东21所、香港9所，澳门7所），由中山大学作为联盟理事会理事长单位，香港中文大学、澳门大学作为副理事长单位，联盟秘书处常设在中山大学港澳台事务办公室。广东工业大学为首批28所入盟高校之一。

联盟自成立之初，就将推动粤港澳三地高校交流合作的纵深发展与融合创新作为工作宗旨，以服务地方和国家发展战略作为历史使命。在相关政府部门经费支持下，通过不断创新与尝试，联盟于过去几年在科研创新、学术交流、人才培养、拓展合作等多个方面开展了一系列卓有成效的工作，并在联盟框架下有序成立了图书馆、超算、空间科学与技术、海洋科技与创新、中文、中医药、公共卫生等多个专业联盟，有效凝聚了三地高校“互学互鉴、共创共享”的合作共识、构建起百花齐放而又特色鲜明的合作体系，为新时期粤港澳高等教育的交流合作开启了新征程，打开了新局面。

2019年2月18日，中共中央、国务院印发《粤港澳大湾区发展规划纲要》（以下简称“《纲要》”），明确指出要将大湾区建设为国际科技创新中心和国际教育示范区，引进世界知名大学和特色学院，推进世界一流大学和一流学科建设；并要充分发挥粤港澳高校联盟的作用，鼓励三地高校探索开展相互承认特定课程学分、实施更灵活的交换生安排、科研成果分享转化等方面交流合作。未来联盟将进一步对标湾区和国家发展需求，利用自身平台资源优势，缔结更多交流合作的硕果，输出更多高水平人才与核心技术成果，为国家“一国两制”的有效落实、继续深化改革开放、积极参与全球交流合作贡献应有的力量。